กะโหลกศีรษะจากหมีถ้ํา Pleistocene ที่สูญพันธุ์ไปแล้ว Ursus spelaeus
(เครดิตภาพ: สถาบันจีโนมร่วม)นักวิทยาศาสตร์ได้คลี่คลายตัวอย่างรหัสพันธุกรรมของสายพันธุ์หมีที่สูญพันธุ์พิสูจน์เทคนิคที่วันหนึ่งอาจทําให้เห็นพฤติกรรมของ Neanderthalsโดยทั่วไปบันทึกฟอสซิลส่วนใหญ่เป็นกระดูกและฟัน แต่บิตของดีเอ็นเอ – พิมพ์เขียวของชีวิต – บางครั้งยึดติดกับตัวอย่างแห้งเหล่านี้ หากสารพันธุกรรมสามารถสกัดได้ก็สามารถให้ข้อมูลมากมายเกี่ยวกับสิ่งมีชีวิตที่ตายแล้ว
นักวิทยาศาสตร์และนักเขียนนิยายวิทยาศาสตร์ใฝ่ฝันที่จะใช้ดีเอ็นเอโบราณเพื่อฟื้นคืนชีพไดโนเสาร์หรือแมมมอธทั้งหมด การศึกษาใหม่พิสูจน์แนวคิดนี้ยังแสดงให้เห็นว่ามันเป็นเรื่องยากมากที่จะใช้กับสิ่งมีชีวิตโบราณมากขึ้นเอ็ดเวิร์ดรูบินของสถาบันจีโนมร่วมของกระทรวงพลังงานและเพื่อนร่วมงานของเขาสามารถจัดลําดับหรือถอดรหัสได้ร้อยละเล็ก ๆ ของจีโนมจากหมีถ้ํา Pleistocene, Ursus spelaeusหมีถ้ําซึ่งเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับหมีสีน้ําตาลสมัยใหม่หายไปกว่า 10,000 ปีที่ผ่านมา ภาพวาดถ้ําและหลักฐานฟอสซิลชี้ให้เห็นว่ามนุษย์โบราณมีการติดต่อกับสัตว์เหล่านี้
ทีมของรูบินวิเคราะห์กระดูกและฟันหมีถ้ําอายุ 40,000 ปีซึ่งรวบรวมจากถ้ําสองแห่งในออสเตรีย สภาพที่ค่อนข้างเย็นและแห้งแล้งเหมาะสมที่สุดสําหรับการอยู่รอดของดีเอ็นเอนักวิทยาศาสตร์ระบุคู่ฐานประมาณ 27,000 คู่ในรหัสดีเอ็นเอของหมีซึ่งโดยรวมแล้วอยู่ที่ไหนสักแห่งที่ยาวประมาณ 3 พันล้านคู่ฐานแต่การจัดลําดับโค้ดทั้งหมดจะใช้เวลานานมาก นักวิทยาศาสตร์พิจารณาการศึกษาหมีตัวนี้เป็นเพียงข้อพิสูจน์ของหลักการเนื่องจากพวกเขาสนใจที่จะสํารวจบรรพบุรุษของมนุษย์มากขึ้น”สิ่งต่อไปคือนีแอนเดอร์ทัล” รูบินกล่าวสายพันธุ์ hominid ที่แข็งแรงนี้เชื่อว่าได้สูญพันธุ์ไปประมาณ 29,000 ปีที่ผ่านมา การมีจีโนมนีแอนเดอร์ทัลเต็มหรือบางส่วนสามารถบอกเราได้ว่ากระดูกไม่สามารถ – เช่นสิ่งที่พวกเขากินสมองของพวกเขาถูกสร้างขึ้นอย่างไรหรือว่าพวกเขาพูดภาษารูบินกล่าวว่า
เทคนิคการสกัดอาจใช้กับซากศพอายุ 18,000 ปีของ Flores Man ที่เพิ่งค้นพบซึ่งมีชื่อเล่นว่า “the hobbit” อย่างไรก็ตามโครงกระดูกที่ลดลงถูกพบในสภาพแวดล้อมเขตร้อนซึ่งน่าจะเร่งกระบวนการย่อยสลายดีเอ็นเอ
การปนเปื้อนของแมลง
นอกจากความจริงที่ว่าดีเอ็นเอจะแตกสลายเมื่อเวลาผ่านไปการจัดลําดับยีนจากฟอสซิลนั้นทําได้ยากเพราะดีเอ็นเอที่พบส่วนใหญ่มาจากสิ่งมีชีวิตที่กินศพ”เมื่อเราตายเราเป็นแหล่งสารอาหารสําหรับจุลินทรีย์และแมลง” Rubin กล่าวการศึกษาที่ผ่านมาได้มุ่งเน้นไปที่ดีเอ็นเอจากไมโตคอนเดรีย ไมโตคอนเดรียเป็นซัพพลายเออร์พลังงานในเซลล์ แต่พวกเขายังมีดีเอ็นเอแยกต่างหากสําหรับการสืบพันธุ์ เนื่องจากมักจะมีหลายพันไมโตคอนเดรียในเซลล์, นักวิจัยมีโชคดีกว่าแยกดีเอ็นเอไมโตคอนเดรียจากฟอสซิล.โดยการหาสายพันธุ์ที่มีดีเอ็นเอไมโตคอนเดรียที่คล้ายกันนักชีววิทยาได้วาดต้นไม้ครอบครัววิวัฒนาการ แต่เพื่อเรียนรู้ว่าสัตว์ที่สูญพันธุ์มีลักษณะอย่างไรหรือมีพฤติกรรมอย่างไรเราต้องจัดลําดับนิวเคลียร์หรือจีโนมดีเอ็นเอซึ่งมีเพียงสองชุดต่อเซลล์
เพื่อไปหลังจากข้อมูลจีโนมทีมของ Rubin เพียงแค่จัดลําดับดีเอ็นเอทุกชิ้นในตัวอย่างซึ่งส่วนใหญ่จบลงด้วยการมาจากจุลินทรีย์ – จากนั้นแยกดีเอ็นเอที่เป็นของหมีออกโดยจับคู่กับจีโนมสุนัขที่รู้จัก
จีโนมหมีเต็มตัวยังไม่ได้รับการจัดลําดับ แต่หมีและสุนัขมีดีเอ็นเอที่คล้ายกัน – มีความแตกต่างประมาณ 50 ล้านปีที่ผ่านมา จากคู่ฐานไม่กี่ล้านคู่นักวิทยาศาสตร์ระบุน้อยกว่าหกเปอร์เซ็นต์ที่มาจากดีเอ็นเอหมี ผลการรายงานในวารสารวิทยาศาสตร์ฉบับออนไลน์ 2 มิถุนายน”มันเป็นงานเรียบร้อย” ริค ไมเออร์จากมหาวิทยาลัยสแตนฟอร์ดกล่าว “นี่เป็นแนวโน้มมากสําหรับการศึกษาความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการในสัตว์ที่เสียชีวิตเมื่อไม่นานมานี้”
การปนเปื้อนของมนุษย์เมื่อเร็ว ๆ นี้นักวิทยาศาสตร์กลุ่มหนึ่งประกาศความพยายามที่จะนําแมมมอธขนแกะกลับมาจากน้ําอสุจิแช่แข็ง ไม่ว่าจะเป็นไปได้หรือไม่ที่จะยังคงเห็นได้เนื่องจากดีเอ็นเออยู่นานเท่านั้น จากข้อมูลของรูบิน 100,000 ปี น่าจะเป็นขีดจํากัดสิ่งนี้จะทําให้ความหวังใด ๆ ของการฟื้นฟูไดโนเสาร์ – ลา “Jurassic Park” แม้ว่าชิ้นส่วนเล็ก ๆ ของดีเอ็นเอจะถูกพบใน, กล่าวว่า, ยุงที่ติดอยู่ในสีเหลืองอําพัน, มันจะยากที่จะพิสูจน์ว่ามันเป็น 100 ล้านปีดีเอ็นเอ.”คุณต้องกังวลเสมอว่ามันมาจากคนงานในห้องแล็บ” รูบินกล่าวนั่นเป็นหนึ่งในเหตุผลที่นักวิทยาศาสตร์เลือกที่จะทดสอบเทคนิคของพวกเขาก่อนด้วยสายพันธุ์ที่ไม่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับมนุษย์เจ้าหน้าที่กระทรวงไม่สามารถยืนยันตัวเลขได้โดยกล่าวว่ายังไม่บรรลุการตัดสินใจอย่างเป็นทางการเกี่ยวกับโครงการซึ่งคาดว่าจะภายในสิ้นเดือนสิงหาคม
แต่เขาบอกว่าหากงบประมาณสําหรับปีหน้าได้รับการอนุมัติกระทรวงหวังว่าจะเสร็จสมบูรณ์ซูเปอร์คอมพิวเตอร์รุ่นต่อไปในบางครั้งในปีงบประมาณ 2010 ซึ่งจะสิ้นสุดในเดือนมีนาคม 2011
ซูเปอร์คอมพิวเตอร์ Earth Simulator ของญี่ปุ่นซึ่งเปิดตัวในปี 2002 นั้นเร็วที่สุดในโลกจนถึงปี 2004 เมื่อ Blue Gene ของ IBM คว้าตําแหน่งเขากล่าวว่า
credit : sanmiguelwritersconferenceblog.org pittsburghentertainment.net jiveentertainmentlive.com nwsafetyservices.com preservingthesaltiness.com
